ประวัติของศาลเจ้าโทเซ็น จินจา ซึ่งเป็นที่รู้จักในนามเทพเจ้าผู้คุ้มครองบ่อน้ำร้อนอาริมะระบุว่า โอนะมูชิ โนะ มิโกโตะ และซุกุนะฮิโคะนะ โนะ มิโกโตะ เป็นผู้ค้นพบบ่อน้ำร้อนแห่งนี้ เมื่อเทพทั้งสององค์มาเยือนอาริมะ มีอีกาที่ได้รับบาดเจ็บสามตัวได้มากินน้ำจากบ่อ ไม่กี่วันต่อมาบาดแผลของอีกาก็หายสนิท ซึ่งบ่งบอกว่าบ่อน้ำดังกล่าวเป็นบ่อน้ำแร่ โดยอีกาทั้งสาม ได้รับอนุญาตให้อาศัยอยู่ที่อาริมะได้ และรู้จักกันในชื่อ “อีกาสามตัวแห่งอาริมะ”

    บ่อน้ำร้อนอาริมะเป็นแหล่งน้ำแร่ที่หายากมากที่สุดแห่งหนึ่งในโลก มีแร่ธาตุและส่วนผสมจากธรรมชาตินานาชนิด ตามปกติบ่อน้ำแร่จะมีแร่ธาตุหลัก 9 ชนิด คือ น้ำพุร้อนธรรมดาน้ำคาร์บอนไดออกไซด์ น้ำไฮโดรเจนคาร์บอเนต น้ำคลอไรด์ น้ำซัลเฟต น้ำธาตุเหล็ก น้ำเรเดียม น้ำกำมะถัน และน้ำที่มีสภาพเป็นกรด พบว่าบ่ออาริมะมีน้ำเกือบครบทุกชนิด ขาดเพียง 2 อย่างหลังเท่านั้น จึงมีสรรพคุณในการรักษาโรค

    บ่อคินเซ็น บ่อน้ำธาตุเหล็กโซเดียมคลอไรด์เข้มข้นที่อุณหภูมิสูง

  1. รักษาโรคแพ้อากาศหนาว โรคปวดหลัง ปวดกล้ามเนื้อ ปวดข้อ โรคเกี่ยวกับเลือด ฯลฯ น้ำพุร้อนช่วยทำให้ผิวชุ่มชื่น เกลือจะสร้างเยื่อบางๆ หุ้มผิว และมีเมต้าซิลิเคทซึ่งทำให้ผิวนุ่มและทำให้ร่างกายอบอุ่นได้นานขึ้น

  2. รักษาอาการติดเชื้อทางผิวหนังและแผลเปื่อยเรื้อรัง มีสรรพคุณในการฆ่าเชื้อโรค

  3. รักษาอาการแพ้ทางผิวหนังทุกชนิดรักษาแผลเปื่อยเรื้อรัง ลมพิษ แผลสด แผลไฟไหม้ มีประจุแคลเซียมจำนวนมากโรคที่สามารถบรรเทาได้ด้วยน้ำพุร้อน

   โรคปวดข้อแบบมีและไม่มีอาการบวม บาดแผลภายนอก การพักฟื้นหลังผ่าตัด อาการบวมในรังไข่เรื้อรัง ภาวะมีบุตรยาก โรคเกี่ยวกับระบบประสาท โรคสะเก็ดเงิน ฯลฯ

   จักรพรรดิโจเมอิ (593-641) และจักรพรรดิโคโตกุ (596-654) ซึ่งเป็นจักรพรรดิองค์ที่ 34 และ 36 ตามลำดับได้เสด็จมาเยือนที่แห่งนี้ ชื่อของบ่อน้ำร้อนอาริมะจึงโด่งดังยิ่งขึ้น

   หนังสือจดหมายเหตุของญี่ปุ่นบันทึกว่า จักรพรรดิโจเมอิ ทรงประทับที่ศาลเจ้าอาริมะ-ออนโตกุ ในเซ็ตซึ เพื่อสรงน้ำเป็นเวลาถึง 86 วัน ตั้งแต่ 8 กันยายนถึง 13 ธันวาคม ค.ศ. 631 ส่วนจักรพรรดิโคโตกุทรงโปรดบ่อน้ำร้อนอาริมะและประทับอยู่ที่นี่นานถึง 82 วันร่วมกับเสนาบดีอาเบะ โนะ คุระฮะชิมาโร่ และ โซกะ โนะ อิชิกาวะมาโร่ พร้อมด้วยเหล่าองค์รักษ์ตั้งแต่ วันที่ 11 ตุลาคมจนถึงก่อนวันขึ้นปีใหม่ในปี ค.ศ. 647

   น้ำแร่ของอาริมะถือว่าเก่าแก่ที่สุดในญี่ปุ่น เป็นแหล่งน้ำธรรมชาติที่มีการใช้กันตั้งแต่สมัยโบราณซึ่งผู้คนยังไม่มีทักษะ ในการขุดเจาะพื้นดิน ในปัจจุบันสามารถขุดเอาน้ำร้อนที่เต็มไปด้วยแร่ธาตุธรรมชาติที่บริเวณใกล้ ผิวดินลึกไม่เกิน 300 เมตร มาใช้ได้เดินทางวันเดียวไปบ่อน้ำร้อนอาริมะ

   อาริมะมีโรงอาบน้ำสาธารณะหรือโซโตยุสองแห่ง คือ คินโนะยุ และกินโนะยุ ซึ่งเหมาะสำหรับผู้เดินทางวันเดียว นอกจากนี้ยังมีบริการน้ำพุร้อนแช่เท้าฟรี (อะชิยุ) ที่ข้างโรงอาบน้ำคินโนะยุ

   บ่อน้ำร้อนอาริมะ ตั้งอยู่บนยอดเขาร็อคโกะ ในเขตกิตะของเมืองโกเบ มีบ่อน้ำร้อนสาธารณะและโรงแรมจำนวนมาก ท่านที่ชื่นชอบการชมทิวทัศน์สามารถเดินทางมายังบริเวณนี้ได้โดยใช้ เคเบิ้ลคาร์ข้ามหุบเขามาถึงตัวเมือง

   การเดินทางโดยรถไฟ จากสถานีซานโนะมิยะหรือชิน-โกเบ นั่งรถไฟใต้ดินไปสถานีทานิกามิ (10 นาที 520 เยนจากซานโนะมิยะ หรือ 8 นาที 350 เยนจากชิน-โกเบ) จากนั้นนั่งรถไฟโกเบสายอาริมะไปสถานีอาริมะ ออนเซ็น เปลี่ยนรถที่สถานีอาริมะกูชิหนึ่งครั้ง (15 นาที 370 เยน) โดยรถบัส รถบัสไปบ่อน้ำร้อนอาริมะออกจากสถานีโอซาก้า (60 นาที 1330 เยน) สถานีชิน-

โอซาก้า (50 นาที 1200 เยน) สถานีชิน-โกเบ (50 นาที 750 เยน) และสถานีขนส่งซานโนะมิยะ (30 นาที 750 เยน)

   องค์การขนส่งเมืองโกเบ ศูนย์กลางการขนส่งเมืองโกเบอยู่ที่ซานโนะมิยะ มีเส้นทางรถไฟ 5 สายทั้งบนดินและใต้ดิน รถไฟสายพอร์ท ไลเนอร์ วิ่งรอบพอร์ท ไอส์แลนด์ จะวิ่งไปสุดสายที่สถานีรถไฟซานโนะมิยะ